按洁净室主要控制对象划分洁净室又可划分为：工业洁净室、生物洁净室。

　　1.工业洁净室主要的控制对象是灰尘粒子（不分有生命的、无生命的）,某些工艺过程还要求控制分子态污染物AMC。
　　工业洁净室主要应用在电子、航天、航空、机械、化工、化学制药、能源、纳米等工业中。尤其是电子工业和光电子工业更是离不开洁净室和洁净技术。
　　2.生物洁净室主要控制对象是有生命的、活的微生物粒子，如病菌、病毒等对人类、动物、环境有害的粒子。
　　生物洁净室广泛地应用在医疗（洁净手术室、洁净病房）、生物制药、实验动物饲养、生物安全实验室、卫生防疫检疫的事业中。生物洁净室的发展速度非常快，而且得到了各方的认同和重视。
　　按气流流型洁净室的分类：单向流洁净室、非单向流洁净室、混合流洁净室、矢流洁净室。
　　单向流（层流）洁净室，其中又分垂直单向流洁净室和水平单向流洁净室。
　　洁净室的四大技术要素：
　　1.送风至少经过三级过滤（粗效、中效和），并且过滤器应设置在系统的末端。
　　2.洁净室应有足够的净化和空调的送风量。
　　3.洁净室应维持必要的压力梯度（正压梯度或负压梯度）。
　　4.洁净室应有合理的气流。
　　洁净室的系统构成：大风量的循环空气（考虑局部排气）和高性能的过滤器；符合需要的控制温湿度的空调设备（要考虑内部发热）；设置控制外部尘埃带入室内的风淋室，传递窗等设备。四周不易粘附尘埃，表面光滑，洁净的房间。
　　空气过滤器
　　洁净空调系统和普通空调系统的主要区别是，它采用多级过滤技术﹑保证尘粒不进入系统和洁净室内的特殊措施，以及满足洁净室要求的气流等。
　　空气过滤器是空气洁净系统中主要的设备。过滤器有三大类：初效过滤器﹑中效过滤器﹑过滤器（或亚过滤器）。
　　初效过滤器主要是阻挡粒径在10微米以上的沉降性尘粒和多种异物。这种过滤器大多采用金属丝网﹑铁屑﹑玻璃丝粗孔聚氨酯泡沫和多种人造纤维做滤材。
　　空调箱由新风段、初效过滤段、预热段、新回风混合段、表冷段、送风段、加热段、加湿段、高中效过滤段组成。
　　静压差控制
　　洁净室的正压要求：为了保持空气免受邻室或外界大气的污染，洁净必须维持一个比邻室和大气高的空气压力，简称维持正压。